Aussitôt, Thomas ouvre une école du matin pour la formation des garçons et organise des prières du soir pour les jeunes et les adultes.
Pendant ces années, Thomas nourrit une profonde dévotion au Christ crucifié et à sa Sainte Mère douloureuse en raison de la mort de son oncle et de son jeune frère.
En 1862, il ouvre une école de théologie morale dans sa maison pour former des prêtres au ministère de la confession. La même année, il fonde également la Société sacerdotale de l'apostolat catholique pour les missions auprès des fidèles.
En 1873, Thomas est profondément ému par le sort d'une jeune fille des rues orpheline. Après un discernement minutieux, il fonde la Congrégation des "Filles de la Charité du Très Précieux Sang".
Pendant le reste de ses années, il se consacre entièrement à son ministère sacerdotal, prêchant des retraites et des missions spirituelles, enseignant le catéchisme aux jeunes et organisant la prière pour les jeunes et les adultes dans sa paroisse. Il s'est efforcé de susciter une forte dévotion au Sang Précieux de Jésus parmi les personnes qu'il servait.
En 1891, Thomas est mort d'une maladie du foie à l'âge de 59 ans.
La cause de sa béatification a été ouverte en 1955 et le décret de ses vertus chrétiennes héroïques a été publié en 2001.
Lors de la béatification de Thomas, le pape Jean-Paul II l'a présenté comme "un exemple et un guide de sainteté pour les prêtres, pour le peuple de Dieu et pour ses filles spirituelles, les Filles de la Charité du Très Précieux Sang".